More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1833 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  100 
 
 		 405 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7490  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  83.21 
 
 		 403 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  48.02 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.83 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.59 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  34.25 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34.25 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.33 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.79 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.88 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  30.71 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.5 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  35.76 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  35.76 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  35.76 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.51 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.69 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.75 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.31 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.78 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.77 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.23 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.68 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.24 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.24 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.3 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.06 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.82 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.06 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.24 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.25 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  30.73 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  30.73 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.43 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  30.73 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  28.79 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.48 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  29.97 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  30.32 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  31.78 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  30.16 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  28.78 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  31.67 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  28.68 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  29.76 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.57 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.65 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.94 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.16 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.02 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  35.9 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  28.06 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  28.32 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  31.4 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  31.6 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.37 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.07 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  28.53 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  29.47 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  29.44 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  29.59 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  30.16 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.43 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.17 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  27.34 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.95 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.43 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  26.99 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  29.75 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  28.25 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  32.13 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.17 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.93 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  29.51 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  29.25 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.66 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  29.14 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.56 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  28.82 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  31.62 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  31.62 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.22 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  29.41 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  29.8 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.31 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  29.17 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  26.95 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  29.56 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  29.26 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  30.07 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  30.7 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  28.68 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.91 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>