173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1832 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  287  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  64.62 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  37.6 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  38.89 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  38.66 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  33.08 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  36.97 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  38.68 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  41.38 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.93 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  41.38 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  41.38 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  34.13 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  34.13 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  33.93 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  37.8 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.34 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  37.63 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.32 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  30.97 
 
 		 576 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.05 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.56 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  34.65 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.89 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  32.46 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.93 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  33.88 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.31 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.63 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  29.23 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  31.3 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  37.65 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.95 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.91 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 319 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  34.19 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  32.2 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  26.85 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  29.23 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  38.82 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.58 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.3 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.85 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  36.97 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  28.46 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.12 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.46 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  37.65 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  35.54 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  31.11 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  31.97 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  33.61 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  26.26 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  27.34 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  35.34 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  29.09 
 
 		 417 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  28.97 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>