More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1831 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1831  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000783197  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6291  hypothetical protein  51.9 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  34.16 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  34.25 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  32.01 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  32.01 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  32.12 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  31.83 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  31.44 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  32.92 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  33.23 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  33.86 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  31.13 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  31.96 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  34.59 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  31.94 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  33.63 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  31.15 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  32.66 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  32.92 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  33.01 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  33.65 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3086  hypothetical protein  32.63 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.72 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  31.27 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  32.23 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.5 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.5 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  29.7 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  31.96 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  30.24 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  31.1 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  30.72 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  30.59 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  31.61 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5507  hypothetical protein  36.05 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  31.67 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  32.53 
 
 		 329 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  31.65 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  32.76 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.74 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  30.46 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  30.84 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  31.31 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  29.23 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  31.65 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  29.39 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  30.7 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.76 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.41 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  29.91 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  32.65 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.01 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  29.94 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  31.02 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  32.88 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  30.51 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  31.85 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  34.87 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  33.71 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  28.04 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  31.82 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  29.97 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  29.85 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5819  hypothetical protein  31.42 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  33.89 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  30.34 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  28.81 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  31.97 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  31.82 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  34.41 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  32 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  30.7 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  32.16 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  30.36 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  27.88 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  29.97 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  28.85 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.99 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  29.97 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  30.2 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  30.85 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  31.87 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  28.14 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  30.74 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  32.24 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  33.57 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  28.23 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  29.77 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3415  hypothetical protein  31.05 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  33.66 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  30.63 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  28.1 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>