More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1807 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1807  PAS:helix-turn-helix, Fis-type:propionate catabolism activator, N-terminal  100 
 
 
663 aa  1321    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  79.57 
 
 
633 aa  987    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0140  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.41 
 
 
660 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5390  Fis family proprionate catabolism activator  49.03 
 
 
660 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420192  normal  0.577921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4843  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.03 
 
 
660 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418321  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3286  Fis family proprionate catabolism activator  48.73 
 
 
660 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749536  normal  0.0314954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  48.43 
 
 
662 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6705  Fis family proprionate catabolism activator  48.38 
 
 
656 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344475  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0880  propionate catabolism operon regulatory protein  48.38 
 
 
694 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1871  propionate catabolism operon regulatory protein  48.38 
 
 
694 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1734  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  48.16 
 
 
697 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0287  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  48.38 
 
 
694 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2144  propionate catabolism operon regulatory protein  48.38 
 
 
694 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0381  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  47.95 
 
 
703 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385394  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1167  propionate catabolism operon regulatory protein  48.38 
 
 
686 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2878  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.93 
 
 
648 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.866934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.58 
 
 
662 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.58 
 
 
662 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2190  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  48.19 
 
 
735 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.03 
 
 
663 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6082  proprionate catabolism activator, Fis family  48.28 
 
 
663 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0387  proprionate catabolism activator, Fis family  47.33 
 
 
652 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.83 
 
 
651 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191772  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0385  proprionate catabolism activator, Fis family  46.55 
 
 
658 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.18 
 
 
651 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3862  proprionate catabolism activator, Fis family  48.31 
 
 
648 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3976  proprionate catabolism activator, Fis family  48.31 
 
 
648 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.966242 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0123  putative propionate catabolism operon regulatory transcription regulator protein  48.35 
 
 
649 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.323531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5404  proprionate catabolism activator, Fis family  43.68 
 
 
678 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000463562  normal  0.497573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  44.38 
 
 
659 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1204  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.13 
 
 
676 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000134686  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4292  transcriptional regulator  42.99 
 
 
645 aa  485  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964315  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2790  sigma-54 dependent sensory box protein  42.31 
 
 
650 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3582  Fis family proprionate catabolism activator  43.47 
 
 
681 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181537  normal  0.0169262 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  39.01 
 
 
639 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.12 
 
 
636 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36000  propionate catabolism operon regulator  46.48 
 
 
473 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0249569  hitchhiker  0.000000000000235786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2722  sigma-54 factor, interaction region  36.03 
 
 
628 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.351091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.89 
 
 
585 aa  306  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3581  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.96 
 
 
467 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0289  Fis family transcriptional regulator  33.39 
 
 
633 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.12 
 
 
703 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  37.09 
 
 
662 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3656  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.46 
 
 
642 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.73 
 
 
591 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.92 
 
 
482 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1966  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.69 
 
 
628 aa  293  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.05 
 
 
690 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.52 
 
 
687 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.88 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.77 
 
 
688 aa  290  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4358  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.95 
 
 
492 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.77 
 
 
470 aa  287  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.71 
 
 
541 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4047  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.79 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  36.92 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.22 
 
 
544 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000701357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.38 
 
 
690 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.34 
 
 
690 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.11 
 
 
690 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2803  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.25 
 
 
569 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.11 
 
 
704 aa  280  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0769  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.36 
 
 
642 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.989517  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0709  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.36 
 
 
642 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  0.481573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2029  hypothetical protein  36.09 
 
 
554 aa  277  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0447  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.27 
 
 
438 aa  277  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0695  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.59 
 
 
642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0812  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.59 
 
 
642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0419  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.49 
 
 
541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530564  normal  0.0144123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0461  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.24 
 
 
541 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3077  sigma54 specific transcriptional regulator  39.57 
 
 
475 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00285  DNA-binding transcriptional activator  43.22 
 
 
528 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.09 
 
 
581 aa  273  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00289  hypothetical protein  43.22 
 
 
528 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3294  Fis family proprionate catabolism activator  43.22 
 
 
528 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0407  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.42 
 
 
541 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0361  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.22 
 
 
528 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.785854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0354  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.22 
 
 
528 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43 
 
 
541 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3276  proprionate catabolism activator, Fis family  42.96 
 
 
528 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0401  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.22 
 
 
528 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.13 
 
 
539 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2710  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.99 
 
 
579 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  37.39 
 
 
527 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0396  propionate catabolism operon regulatory protein PrpR  43.32 
 
 
528 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.14 
 
 
575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0455  helix-turn-helix, Fis-type  40.51 
 
 
468 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1544  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.59 
 
 
568 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.01 
 
 
643 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2392  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.09 
 
 
652 aa  270  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2361  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.32 
 
 
450 aa  269  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.23 
 
 
558 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.48 
 
 
655 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.37 
 
 
661 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>