More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1795 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1795  porin  100 
 
 
362 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  40.57 
 
 
359 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  43.25 
 
 
356 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  43.69 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  43.38 
 
 
352 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  43.38 
 
 
352 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  42.94 
 
 
356 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  41.03 
 
 
358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  38.04 
 
 
367 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  41.34 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  40.23 
 
 
361 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  41.34 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  39.64 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  41.34 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  39.76 
 
 
361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  40 
 
 
358 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  40.31 
 
 
358 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  40.18 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  40.18 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  40.18 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  41.32 
 
 
357 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  40 
 
 
358 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  39.69 
 
 
358 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  39.08 
 
 
357 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  39.08 
 
 
357 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  39.08 
 
 
357 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  40.72 
 
 
357 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  39.27 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  39.27 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  39.35 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  38.22 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  37.5 
 
 
363 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.44 
 
 
340 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  44.32 
 
 
332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  36.9 
 
 
365 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  37.13 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  36.66 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  36.11 
 
 
341 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  36.63 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  38.34 
 
 
340 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  36.5 
 
 
342 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  33.24 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  33.51 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.33 
 
 
352 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34.76 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  33.13 
 
 
335 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  32.78 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.15 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.62 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  32.58 
 
 
339 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30 
 
 
350 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  32.18 
 
 
351 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  40.33 
 
 
349 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  32.11 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  32.3 
 
 
394 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.21 
 
 
392 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.49 
 
 
368 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.21 
 
 
358 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  33.66 
 
 
363 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  30.35 
 
 
348 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.77 
 
 
396 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.23 
 
 
449 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.62 
 
 
362 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.02 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  32.17 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.38 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.7 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.02 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.02 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  31.69 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  29.27 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.02 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.02 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.33 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  29.81 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.98 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  34 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30.53 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  32.73 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  30.15 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  30.15 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.64 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.75 
 
 
358 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  32.55 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  28.61 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.48 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  30.6 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.48 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  32.21 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.85 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  32.21 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.49 
 
 
375 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.88 
 
 
350 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  30.81 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  34.48 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.88 
 
 
350 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.27 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.54 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  30.93 
 
 
348 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.12 
 
 
376 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>