34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1751 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1751  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2133  hypothetical protein  72.68 
 
 
192 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2125  hypothetical protein  71.5 
 
 
200 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5109  hypothetical protein  75.77 
 
 
194 aa  235  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5539  hypothetical protein  71.13 
 
 
194 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642633  normal  0.0183709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2546  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  229  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3573  hypothetical protein  70.41 
 
 
196 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0597766  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3947  hypothetical protein  73.47 
 
 
196 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180618  normal  0.604818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3488  hypothetical protein  72.45 
 
 
196 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00401228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5307  hypothetical protein  71.94 
 
 
196 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1321  hypothetical protein  68.56 
 
 
259 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5721  hypothetical protein  51.36 
 
 
325 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277173  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1544  hypothetical protein  66.49 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1456  hypothetical protein  66.49 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0044  hypothetical protein  65.46 
 
 
278 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3695  hypothetical protein  56.19 
 
 
212 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.841303  normal  0.591313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0498  hypothetical protein  55.3 
 
 
212 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3678  hypothetical protein  60.42 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0057  hypothetical protein  58.25 
 
 
184 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3738  hypothetical protein  51.76 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  52.98 
 
 
320 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003557  hypothetical protein  54.26 
 
 
210 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000457432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1304  hypothetical protein  58.9 
 
 
241 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1231  hypothetical protein  53.29 
 
 
199 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0559905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02518  hypothetical protein  53.49 
 
 
210 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  55.73 
 
 
210 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0989  hypothetical protein  48.21 
 
 
139 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3132  hypothetical protein  55.36 
 
 
271 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3034  hypothetical protein  56.25 
 
 
200 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3233  hypothetical protein  55.36 
 
 
271 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0344  hypothetical protein  52.07 
 
 
178 aa  130  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2053  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0738137  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2808  hypothetical protein  40.45 
 
 
186 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0150  hypothetical protein  43.36 
 
 
238 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>