More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1726 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  60.87 
 
 		 641 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 642 aa  1319    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  39.55 
 
 		 668 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  38.78 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  39.06 
 
 		 668 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.29 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  37.87 
 
 		 668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.6 
 
 		 683 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.33 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  35.83 
 
 		 643 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  36.93 
 
 		 689 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  34.38 
 
 		 741 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  33.7 
 
 		 777 aa  356  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  36.51 
 
 		 689 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  35.06 
 
 		 778 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  34.3 
 
 		 619 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  35.05 
 
 		 730 aa  349  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 731 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  36.24 
 
 		 794 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  32.47 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.39 
 
 		 741 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  36.47 
 
 		 792 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 769 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  35.15 
 
 		 645 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  36.53 
 
 		 645 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  37.17 
 
 		 712 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 618 aa  343  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.07 
 
 		 741 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.84 
 
 		 735 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  35.4 
 
 		 780 aa  340  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 		 907 aa  339  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 		 757 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  35.35 
 
 		 731 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.32 
 
 		 616 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 		 756 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.27 
 
 		 785 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 		 755 aa  336  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.85 
 
 		 796 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  34.41 
 
 		 734 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.09 
 
 		 741 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 703 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 788 aa  331  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  32.95 
 
 		 741 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 		 748 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  37.47 
 
 		 838 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 		 774 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  37.27 
 
 		 841 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  37.27 
 
 		 841 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  36.87 
 
 		 841 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  34.08 
 
 		 734 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  33.51 
 
 		 709 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  32.92 
 
 		 753 aa  327  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  37.52 
 
 		 732 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  34.57 
 
 		 661 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.63 
 
 		 572 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  32.4 
 
 		 1057 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.18 
 
 		 692 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  32.78 
 
 		 692 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  32.4 
 
 		 1048 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  35.75 
 
 		 617 aa  320  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  36.22 
 
 		 617 aa  319  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  34.64 
 
 		 740 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  34.59 
 
 		 740 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 		 655 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.91 
 
 		 618 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  35.47 
 
 		 616 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  33.43 
 
 		 794 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  35.41 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  35.03 
 
 		 615 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32.4 
 
 		 858 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  33.91 
 
 		 678 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 724 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32.4 
 
 		 930 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32.4 
 
 		 896 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  31.14 
 
 		 694 aa  313  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.46 
 
 		 754 aa  312  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 		 872 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  32.64 
 
 		 714 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 694 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.63 
 
 		 754 aa  309  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.81 
 
 		 771 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  34.49 
 
 		 767 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 699 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 775 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 775 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 775 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 775 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  30.75 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>