More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1667 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  76.77 
 
 
254 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  67.19 
 
 
254 aa  352  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
254 aa  322  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
253 aa  318  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  68.38 
 
 
254 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
247 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
247 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
247 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  64.57 
 
 
254 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  64.52 
 
 
260 aa  309  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.35 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  65.22 
 
 
273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.81 
 
 
254 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.45 
 
 
254 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
254 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.52 
 
 
253 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.48 
 
 
254 aa  272  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
262 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.56 
 
 
256 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.4 
 
 
285 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
255 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 
249 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0811  short chain enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
255 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
264 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
273 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
261 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 
264 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 
268 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.01 
 
 
267 aa  181  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.92 
 
 
240 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  42.59 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  41.83 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  42.97 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
266 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
287 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
297 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  43.4 
 
 
297 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
269 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
261 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.4 
 
 
261 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
261 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.59 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  42.59 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
297 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
261 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  42.59 
 
 
261 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
259 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
261 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 
249 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
261 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
249 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
249 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  43.4 
 
 
261 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
263 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
269 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
269 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
269 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
269 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
271 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
797 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  40.15 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
261 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  38.17 
 
 
260 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
256 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.65 
 
 
283 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
257 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
256 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
257 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  37.16 
 
 
264 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
264 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
267 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.02 
 
 
260 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
261 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.5 
 
 
272 aa  154  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  37.79 
 
 
260 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
256 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.63 
 
 
260 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
271 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.47 
 
 
250 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0542068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>