More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1645 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  100 
 
 		 570 aa  1169    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  58.09 
 
 		 603 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  57.09 
 
 		 576 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  56.34 
 
 		 576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  55.6 
 
 		 575 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  48.84 
 
 		 640 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  50 
 
 		 534 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  48.75 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  48.11 
 
 		 667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  45.61 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  45.61 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  43.17 
 
 		 665 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  39.28 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  39.28 
 
 		 563 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  40.44 
 
 		 608 aa  418  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  39.34 
 
 		 662 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  39.31 
 
 		 658 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  38.75 
 
 		 660 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  38.87 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 660 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  39.11 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  38.28 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  37.2 
 
 		 662 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  37.43 
 
 		 667 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  36.03 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  36.38 
 
 		 669 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  35.53 
 
 		 590 aa  334  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.21 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  36.21 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  38 
 
 		 614 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  37.22 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  36.49 
 
 		 575 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  37.46 
 
 		 614 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  37.41 
 
 		 614 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  36.3 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  36.46 
 
 		 613 aa  316  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  35.95 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  33.72 
 
 		 621 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  34.31 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  34.95 
 
 		 606 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  36.1 
 
 		 595 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  33.87 
 
 		 589 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  33.87 
 
 		 589 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  33.87 
 
 		 589 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.11 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  33.69 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.7 
 
 		 586 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  33.51 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 588 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  34.49 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  33.33 
 
 		 589 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  34.4 
 
 		 630 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  34.04 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  35.59 
 
 		 606 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  34.64 
 
 		 583 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  32.68 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  33.68 
 
 		 712 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  33.03 
 
 		 577 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  33.22 
 
 		 605 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  33.8 
 
 		 626 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  33.39 
 
 		 713 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.62 
 
 		 592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  33.68 
 
 		 704 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  34.26 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  32.47 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  33.57 
 
 		 602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  33.21 
 
 		 589 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  34.4 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.41 
 
 		 595 aa  286  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  34.4 
 
 		 597 aa  286  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.57 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  32.88 
 
 		 704 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  33.74 
 
 		 712 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  33.1 
 
 		 708 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  35.3 
 
 		 572 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.82 
 
 		 636 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.82 
 
 		 634 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.83 
 
 		 639 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  30.82 
 
 		 636 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  32.98 
 
 		 701 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.05 
 
 		 635 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  32.87 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  31.93 
 
 		 637 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  32.97 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.15 
 
 		 563 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  31.08 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  32.56 
 
 		 651 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  32 
 
 		 642 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  30.6 
 
 		 626 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>