197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1605 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  74.3 
 
 
215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  66.51 
 
 
221 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  64.15 
 
 
217 aa  294  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  65.57 
 
 
221 aa  294  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  62.26 
 
 
216 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  49.77 
 
 
215 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  48.83 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  48.13 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  49.77 
 
 
232 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  47.27 
 
 
248 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  46.63 
 
 
212 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  47.93 
 
 
220 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  45.45 
 
 
221 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  45.07 
 
 
214 aa  204  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 
222 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  48.83 
 
 
227 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  42.4 
 
 
221 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  50.47 
 
 
228 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  46.26 
 
 
218 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  45.97 
 
 
220 aa  187  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 
213 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 
220 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  40.65 
 
 
222 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.32 
 
 
219 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 
215 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  38.94 
 
 
211 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
217 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 
216 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  33.02 
 
 
214 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 
230 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 
221 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 
224 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  35.24 
 
 
217 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.51 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.51 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  35.62 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
215 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 
215 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 
256 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  36.2 
 
 
227 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
223 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.56 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 
235 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.38 
 
 
230 aa  124  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 
222 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  30.23 
 
 
242 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
235 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.02 
 
 
218 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
221 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
221 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
237 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  35.05 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
218 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
234 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
214 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
225 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.17 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  35.07 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
211 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
216 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
243 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
243 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  33.17 
 
 
243 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  30.99 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  32.69 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.21 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  32.21 
 
 
243 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  32.69 
 
 
243 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>