More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1599 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  100 
 
 
386 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  74.42 
 
 
386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  63.75 
 
 
388 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  64.01 
 
 
387 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  62.97 
 
 
393 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  64.4 
 
 
387 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  58.27 
 
 
387 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  60.05 
 
 
391 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  55.36 
 
 
398 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  44.29 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3144  porin  50.89 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  47.51 
 
 
378 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  43.58 
 
 
379 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  43.48 
 
 
392 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  43.48 
 
 
392 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  45.27 
 
 
367 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  43.22 
 
 
384 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  45.23 
 
 
382 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  45.69 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  43.92 
 
 
381 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  43.73 
 
 
354 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  41.65 
 
 
402 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  42.01 
 
 
379 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  39.27 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  41.22 
 
 
352 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  41.51 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  39 
 
 
371 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  41.49 
 
 
368 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  39.29 
 
 
356 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  40.26 
 
 
401 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  36.97 
 
 
362 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  39.95 
 
 
353 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  38.63 
 
 
368 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  40.15 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  40.15 
 
 
386 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  39.9 
 
 
379 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  40.85 
 
 
355 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  39.39 
 
 
355 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  39.39 
 
 
355 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  37.38 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  37.38 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  38.39 
 
 
358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  39.85 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  37.13 
 
 
383 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  38.23 
 
 
355 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  39.44 
 
 
377 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  36.96 
 
 
383 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  36.8 
 
 
357 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  36.63 
 
 
383 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  37.12 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  34.6 
 
 
367 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  36.93 
 
 
351 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  36.99 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  36.84 
 
 
353 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  39.84 
 
 
363 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  39.53 
 
 
364 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.05 
 
 
354 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.05 
 
 
354 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.2 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.74 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  34.16 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  38.4 
 
 
363 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  36.03 
 
 
365 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  36.88 
 
 
372 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  38.73 
 
 
363 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  34.08 
 
 
361 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  34.57 
 
 
357 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  37.89 
 
 
371 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  38 
 
 
273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.03 
 
 
449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.26 
 
 
363 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.26 
 
 
363 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.77 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.77 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.77 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  33.89 
 
 
413 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
359 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
359 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
359 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
359 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2917  outer membrane porin  31.9 
 
 
359 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1274  porin  31.9 
 
 
359 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.688217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  34.18 
 
 
379 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.09 
 
 
358 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.01 
 
 
363 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.7 
 
 
383 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.75 
 
 
384 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.8 
 
 
386 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  34.1 
 
 
373 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  34.61 
 
 
384 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  34.61 
 
 
384 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  34.35 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  35.91 
 
 
392 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  34.35 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  34.35 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  36.28 
 
 
386 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  36.83 
 
 
387 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  34.1 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.52 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.91 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>