106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1550 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  40.77 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  39.37 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  35.46 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  35.88 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  37.04 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  34.51 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  34.56 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.37 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  33.57 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.85 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  29.37 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  30.08 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  27.91 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  34.68 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  31.5 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  33.6 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.79 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.84 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  31.09 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2878  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2922  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2908  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321765  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  29.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  30.28 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  32.79 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  30.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  27.54 
 
 		 178 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  30.83 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  35.25 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  30.66 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  30.23 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  34.38 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  28.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  31.2 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.2 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  30.08 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  30.08 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  30.47 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  33.61 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  28.32 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  27.74 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  32.8 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  27.82 
 
 		 221 aa  43.9  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  28.23 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  30.53 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  30.99 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  29.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  31.19 
 
 		 185 aa  43.5  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  32.35 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  24.82 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  30.63 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  24.81 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  28.35 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  28.35 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  25.37 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  26.71 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  28.07 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  25.66 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0322  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.753161  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  27.61 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0320  hypothetical protein  37.04 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  29.85 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  28.69 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>