More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1515 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.06 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.2 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.91 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.5 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.41 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.6 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  46.03 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  45.16 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.85 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.67 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.67 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.67 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  31.2 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>