More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1504 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  849    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 428 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 409 aa  345  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 423 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  43.07 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 425 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  41.69 
 
 		 429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 427 aa  328  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  41.95 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  41.61 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 420 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  41.41 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  41.26 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 428 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  42.45 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  42.55 
 
 		 445 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  42.55 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  41.02 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 432 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  39.36 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  30.6 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  33 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 491 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 408 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  34.97 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.79 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>