More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1420 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 327 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  88.69 
 
 		 327 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  78.57 
 
 		 323 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  78.57 
 
 		 323 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  63.18 
 
 		 315 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  61.47 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  61.23 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  50.62 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  44.31 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  45.23 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  45.64 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  45.89 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  42.86 
 
 		 332 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  43.83 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  42.06 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  44.21 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  41.23 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  40.25 
 
 		 318 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  39.86 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  38.7 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  43.62 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  36.1 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.42 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.07 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  38.51 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.72 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.38 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.95 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.96 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.19 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.13 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.18 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.62 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.76 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.77 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.77 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.96 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  35.91 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.91 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.42 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  35.35 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  37.77 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.14 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.83 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.33 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  37.12 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.31 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.2 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.66 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  34.35 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.83 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.84 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.69 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  34.93 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  39.81 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.59 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.19 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.4 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.53 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.89 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  34.25 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  35.96 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 348 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  35.93 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  34.8 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.59 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.37 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.55 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  35.86 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  34.85 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.84 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.64 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.05 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  36.54 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.14 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.88 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  34.65 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.56 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.38 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  36.45 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  34.89 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  34.62 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  35.41 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>