More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1410 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 165 aa  339  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  70.47 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  68.35 
 
 		 144 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 144 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 144 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  56.67 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  55.83 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  55.83 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  55.83 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  55 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  55 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  52.86 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  52.38 
 
 		 143 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  54.17 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  52.21 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  50.39 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  53.28 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  52 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  47.69 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  51.94 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  53.54 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 137 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  38.84 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  35.59 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  36.92 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.81 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  34.31 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  29.08 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.58 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.66 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>