290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1277 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  98.46 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  92.31 
 
 		 65 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  92.31 
 
 		 65 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  90.77 
 
 		 65 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  73.85 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  75.81 
 
 		 62 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  77.78 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  60 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  63.49 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0294  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>