299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1267 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
133 aa  279  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  81.2 
 
 
133 aa  236  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  60.48 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  55.04 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  58.87 
 
 
132 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
142 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  58.06 
 
 
132 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  56.15 
 
 
159 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  56.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
136 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 
139 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
139 aa  137  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
140 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  57.28 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
135 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
136 aa  120  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  42.97 
 
 
134 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
156 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  43.75 
 
 
134 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  39.23 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  96.7  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.31 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.03 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  28.15 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  27.41 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  28.99 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  31.09 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  32.58 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  27.27 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  40.79 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>