More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1197 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  649  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4951  extra-cytoplasmic solute receptor  63.12 
 
 
329 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546864  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.51 
 
 
330 aa  336  3e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49 
 
 
330 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48.62 
 
 
336 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.34 
 
 
339 aa  320  2e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.46 
 
 
360 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.68 
 
 
328 aa  318  8e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  48.9 
 
 
321 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.17 
 
 
324 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  47.56 
 
 
344 aa  312  4e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.34 
 
 
328 aa  311  8e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.84 
 
 
328 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.84 
 
 
328 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  49.03 
 
 
345 aa  307  1e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  49.03 
 
 
345 aa  307  1e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  50.17 
 
 
333 aa  307  1e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  306  2e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.82 
 
 
325 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.44 
 
 
339 aa  305  1e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  47.98 
 
 
331 aa  305  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  50.5 
 
 
336 aa  304  2e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.84 
 
 
328 aa  302  4e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.54 
 
 
327 aa  301  7e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.99 
 
 
339 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.43 
 
 
328 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  49.83 
 
 
335 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.79 
 
 
334 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.99 
 
 
344 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.55 
 
 
333 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.67 
 
 
335 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.98 
 
 
335 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.84 
 
 
330 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.63 
 
 
318 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.2 
 
 
326 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  47.63 
 
 
322 aa  285  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  47.16 
 
 
323 aa  284  1e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.14 
 
 
349 aa  283  2e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  48.49 
 
 
326 aa  284  2e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  45.11 
 
 
324 aa  282  4e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 
331 aa  282  5e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  45.36 
 
 
335 aa  282  5e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.34 
 
 
324 aa  282  6e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  49.66 
 
 
324 aa  282  6e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  43.83 
 
 
323 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  48.32 
 
 
325 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  45.48 
 
 
337 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.79 
 
 
326 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.81 
 
 
341 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 
330 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  45.36 
 
 
335 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  47.96 
 
 
339 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47 
 
 
358 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  46.08 
 
 
331 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44 
 
 
327 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.78 
 
 
322 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.43 
 
 
334 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.12 
 
 
327 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.33 
 
 
324 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.79 
 
 
338 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.12 
 
 
325 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 
332 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.76 
 
 
318 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.83 
 
 
334 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.85 
 
 
314 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45 
 
 
330 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45 
 
 
330 aa  275  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.62 
 
 
356 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.06 
 
 
325 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 
348 aa  274  1e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  44.62 
 
 
324 aa  275  1e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.74 
 
 
337 aa  274  2e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.15 
 
 
339 aa  274  2e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.41 
 
 
323 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.36 
 
 
334 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.82 
 
 
327 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  44.65 
 
 
322 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  41.37 
 
 
322 aa  272  5e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 
335 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.74 
 
 
330 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  46.37 
 
 
327 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  44.48 
 
 
326 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.99 
 
 
336 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  44.55 
 
 
343 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.47 
 
 
325 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.43 
 
 
323 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.54 
 
 
325 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81341e-10 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.78 
 
 
326 aa  270  3e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  46.74 
 
 
317 aa  270  3e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.59 
 
 
328 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  44.12 
 
 
329 aa  268  6e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  43.85 
 
 
327 aa  269  6e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.49 
 
 
332 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  46.39 
 
 
317 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.74 
 
 
325 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  45.51 
 
 
331 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 
328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  43.1 
 
 
325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.06 
 
 
321 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.85 
 
 
334 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>