More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1183 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  100 
 
 
286 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  75.52 
 
 
295 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  70.63 
 
 
293 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  63.29 
 
 
298 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  66.9 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  65.84 
 
 
287 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  60.99 
 
 
285 aa  371  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  60.5 
 
 
300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  50.17 
 
 
286 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 
305 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 
291 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.26 
 
 
258 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  29.15 
 
 
288 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.75 
 
 
271 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  25.17 
 
 
307 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
289 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
312 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  27.3 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.49 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.88 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  30.25 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  27.47 
 
 
279 aa  95.5  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  31.16 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  29.69 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  27.86 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.1 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  27.08 
 
 
281 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.43 
 
 
285 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  31.23 
 
 
284 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.66 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.3 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  29.1 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  29.88 
 
 
277 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  30.74 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  30.2 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
289 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.31 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  28.28 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  29.39 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.42 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 
610 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  30.42 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.21 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.25 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
289 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  30.3 
 
 
279 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.28 
 
 
284 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 
477 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  29.86 
 
 
283 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  28.67 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  25.63 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  27.53 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  25.84 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  25.97 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  27.53 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  30.57 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 
284 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.21 
 
 
277 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.28 
 
 
285 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  25.56 
 
 
290 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.83 
 
 
284 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 
288 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  24.83 
 
 
284 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.86 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  27.13 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 
287 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  30.54 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  29.83 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  26.79 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  27.74 
 
 
277 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.48 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  24.55 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.48 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  27.74 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  27.74 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
355 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  27.8 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  27.05 
 
 
283 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  26.76 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.67 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  23.93 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.49 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>