More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1144 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 452 aa  924    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  70.13 
 
 		 454 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  70.13 
 
 		 454 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  68.36 
 
 		 452 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  64.38 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  56.29 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  54.77 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  53.35 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  53.1 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  49.34 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  53.32 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  49.12 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  50.22 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  52.54 
 
 		 455 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  52.21 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  52.99 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  54.61 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  50.78 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  51.55 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  50.98 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 		 467 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  47.98 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  49 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  49.78 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  49.78 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  49.78 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  50.55 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  49.78 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 603 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  50.11 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  50.23 
 
 		 454 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  50.22 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  51.13 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  50.22 
 
 		 589 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.35 
 
 		 468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  49 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  49.55 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  48.34 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  50.34 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  49.34 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  50.9 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  50.9 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 		 460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  49.78 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  43.81 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  47.58 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.25 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  39.61 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.06 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.83 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41 
 
 		 524 aa  358  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 		 525 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.23 
 
 		 464 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  42.01 
 
 		 464 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.43 
 
 		 525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.52 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.77 
 
 		 469 aa  339  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.26 
 
 		 540 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.73 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.84 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  39.14 
 
 		 535 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.98 
 
 		 469 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.39 
 
 		 541 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.67 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 570 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 		 462 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  41.79 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.76 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.76 
 
 		 480 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.53 
 
 		 480 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.51 
 
 		 467 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.21 
 
 		 467 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.65 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 467 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  37.83 
 
 		 536 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.51 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.18 
 
 		 480 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.64 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  39.82 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.63 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.63 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 		 467 aa  302  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>