More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1037 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  100 
 
 
371 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  85.44 
 
 
371 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  79.51 
 
 
371 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  79.25 
 
 
371 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  78.98 
 
 
371 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  61.97 
 
 
364 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  59.78 
 
 
364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  61.14 
 
 
354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  60.67 
 
 
356 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  60.57 
 
 
356 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  60.11 
 
 
356 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  61.71 
 
 
354 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  61.71 
 
 
354 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  56.75 
 
 
367 aa  424  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  61.43 
 
 
354 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  61.8 
 
 
367 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  62.08 
 
 
355 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  61.52 
 
 
367 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  61.71 
 
 
354 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  61.71 
 
 
354 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  61.43 
 
 
355 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  58.38 
 
 
369 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  56.13 
 
 
365 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  56.49 
 
 
368 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  56.61 
 
 
363 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  53.48 
 
 
367 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  54.28 
 
 
367 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  56.94 
 
 
365 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  55.56 
 
 
398 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  54.28 
 
 
367 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  53.47 
 
 
370 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  54.11 
 
 
369 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  55.59 
 
 
352 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  55.59 
 
 
352 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  56.16 
 
 
354 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  51.44 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  51.6 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.18 
 
 
371 aa  353  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  49.87 
 
 
364 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  55.86 
 
 
354 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  46.4 
 
 
368 aa  343  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  47.86 
 
 
370 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46 
 
 
359 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.61 
 
 
337 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.61 
 
 
337 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48.63 
 
 
337 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  48.02 
 
 
327 aa  332  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47.9 
 
 
327 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  48.18 
 
 
355 aa  330  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  48.33 
 
 
327 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  48.13 
 
 
373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47.88 
 
 
327 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  46.44 
 
 
378 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  45.11 
 
 
360 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  47.42 
 
 
337 aa  322  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  48.7 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  48.7 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.25 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.25 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.41 
 
 
347 aa  319  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45.95 
 
 
337 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  45.95 
 
 
337 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.69 
 
 
371 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  48.41 
 
 
348 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  45.9 
 
 
337 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  47.83 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  46.26 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  46.27 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.26 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  46.26 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  47.69 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  47.87 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  46.33 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  46.41 
 
 
335 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  44.08 
 
 
345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  45.69 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  49.85 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  47.43 
 
 
327 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.77 
 
 
320 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.63 
 
 
325 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  48.66 
 
 
328 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  48.05 
 
 
337 aa  299  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.45 
 
 
343 aa  299  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  46.46 
 
 
340 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  45.21 
 
 
354 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  47.38 
 
 
320 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  45.59 
 
 
320 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  45.59 
 
 
320 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  45.59 
 
 
320 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  49.04 
 
 
320 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  49.04 
 
 
320 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  49.04 
 
 
320 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  49.43 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  45.35 
 
 
362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  49.04 
 
 
320 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>