More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0922 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  836    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  59.57 
 
 
657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  59.89 
 
 
654 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  71.73 
 
 
616 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  51.91 
 
 
535 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  49.08 
 
 
570 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  47.4 
 
 
523 aa  249  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
698 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  50.22 
 
 
497 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  52.19 
 
 
491 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  47.3 
 
 
611 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  45.38 
 
 
291 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  42.34 
 
 
292 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  35.47 
 
 
586 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  44 
 
 
289 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  41.22 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  38.57 
 
 
277 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 
616 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  38.46 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  39.06 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  38.72 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  37.74 
 
 
286 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  38.37 
 
 
288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  39.92 
 
 
292 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  38.28 
 
 
283 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  39.31 
 
 
293 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  38.15 
 
 
303 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 
628 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  39.64 
 
 
620 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.03 
 
 
416 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  36.93 
 
 
636 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  39.34 
 
 
292 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  33.12 
 
 
556 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  35.56 
 
 
603 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  35.98 
 
 
802 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.84 
 
 
240 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
882 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  38.4 
 
 
351 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.02 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  36.69 
 
 
246 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.02 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.82 
 
 
269 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  39.92 
 
 
740 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
625 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  38.36 
 
 
522 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 
618 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.03 
 
 
358 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.25 
 
 
426 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.68 
 
 
781 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  37.83 
 
 
267 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  37.82 
 
 
336 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
621 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
593 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  38.26 
 
 
587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
620 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  33.13 
 
 
1132 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  36.09 
 
 
611 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.54 
 
 
820 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.7 
 
 
877 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 
346 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.56 
 
 
1911 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  35.04 
 
 
287 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  34.36 
 
 
1104 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.4 
 
 
892 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.69 
 
 
925 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  35.91 
 
 
929 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  34.63 
 
 
551 aa  136  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  34.81 
 
 
281 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
654 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.06 
 
 
293 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  38.38 
 
 
538 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  33.06 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.68 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.21 
 
 
1196 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  32.89 
 
 
952 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  33.71 
 
 
293 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  38.49 
 
 
263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  35.77 
 
 
253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 
453 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  37.33 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  36.33 
 
 
664 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
623 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  33.84 
 
 
305 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  31.09 
 
 
624 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
639 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
639 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.04 
 
 
751 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36.94 
 
 
527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  36.2 
 
 
862 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  32.6 
 
 
922 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
509 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.57 
 
 
251 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 
288 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  34.06 
 
 
279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  33.05 
 
 
285 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  37.36 
 
 
605 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.33 
 
 
826 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>