More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0865 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  73.51 
 
 		 460 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  75.89 
 
 		 460 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  76.13 
 
 		 460 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  51.41 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.28 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 423 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 423 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.39 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 425 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.12 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.12 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.12 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.12 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.82 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.22 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  31.03 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  30.41 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.33 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  31.45 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  31.22 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  31.42 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.9 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  33.16 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.9 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.55 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.65 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.95 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.95 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.65 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  30.47 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  30.47 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  30.47 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  31.37 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  30.47 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  30.47 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  32.7 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  32.91 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  32.7 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  32.91 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  29.9 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  32.91 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  32.91 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  32.91 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  30.39 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  29.66 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  33.16 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  31.99 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>