155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0809 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  74.63 
 
 
213 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  74.63 
 
 
213 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  73.66 
 
 
255 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  74.15 
 
 
213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  74.15 
 
 
213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  74.15 
 
 
213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  74.15 
 
 
213 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  72.68 
 
 
242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  72.2 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  72.2 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  72.2 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  72.68 
 
 
242 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  72.2 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  72.2 
 
 
242 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  70.05 
 
 
212 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  74.04 
 
 
209 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  75 
 
 
209 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  73.08 
 
 
209 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  70.67 
 
 
213 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  70.19 
 
 
213 aa  297  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  70.73 
 
 
212 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  70.73 
 
 
213 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  69.27 
 
 
209 aa  287  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  59.55 
 
 
221 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  60.1 
 
 
209 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  59.71 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  57.08 
 
 
223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  57.97 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  57.14 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  55.34 
 
 
209 aa  218  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  50.49 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  46.8 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  41.79 
 
 
209 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  41.29 
 
 
209 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  41.29 
 
 
209 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  41.29 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  41.29 
 
 
209 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  40.8 
 
 
209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  41.29 
 
 
209 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  40.29 
 
 
209 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  40.3 
 
 
209 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  40.29 
 
 
209 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  39.9 
 
 
209 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  41.09 
 
 
213 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  43.78 
 
 
200 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  35.44 
 
 
208 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  35.44 
 
 
208 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  35.85 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  33.79 
 
 
215 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.71 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  31.22 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  36.19 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.37 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  32.86 
 
 
209 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  34.15 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.19 
 
 
226 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  36.71 
 
 
210 aa  105  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  33.66 
 
 
203 aa  104  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  31.28 
 
 
209 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  33.96 
 
 
237 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.16 
 
 
209 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.27 
 
 
213 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.27 
 
 
213 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.16 
 
 
215 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  29.27 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.44 
 
 
213 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  27.09 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  29.06 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  29.47 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  28.08 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  27.59 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  26.52 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.49 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.36 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  29.56 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.62 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.6 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  31.63 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  32.85 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.76 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.75 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.67 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.37 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.75 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  28.41 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.51 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.09 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  25.37 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28.99 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.38 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.19 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.5 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.07 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.23 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  25.81 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.71 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.19 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  24.36 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.57 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>