More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0752 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  42.84 
 
 		 1496 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1071 aa  2155    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  44.15 
 
 		 1470 aa  857    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  49.29 
 
 		 1065 aa  976    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  43.85 
 
 		 1041 aa  846    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1054 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  40.04 
 
 		 1028 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  57.96 
 
 		 1066 aa  1194    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1055 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  58.75 
 
 		 1095 aa  1260    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  44.14 
 
 		 1032 aa  894    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  58.96 
 
 		 1075 aa  1216    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  44.18 
 
 		 1036 aa  851    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  42.65 
 
 		 1038 aa  782    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  41.17 
 
 		 1067 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  45 
 
 		 1039 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  48.71 
 
 		 1033 aa  922    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1054 aa  716    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1054 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  60.09 
 
 		 1070 aa  1261    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  59.85 
 
 		 1069 aa  1275    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  39.84 
 
 		 1028 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  38.53 
 
 		 1028 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1050 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1034 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.31 
 
 		 1044 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 		 1028 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  34.6 
 
 		 1062 aa  588  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1047 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1044 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1073 aa  575  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1058 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1034 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 		 1043 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1045 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1038 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  34.28 
 
 		 1026 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.87 
 
 		 1050 aa  547  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1058 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  35.04 
 
 		 1028 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1009 aa  545  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1044 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1048 aa  542  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1063 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.3 
 
 		 1068 aa  542  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1044 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1011 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1035 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1101 aa  539  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1031 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1031 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1035 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1031 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1027 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1041 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.79 
 
 		 1036 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  33.05 
 
 		 1013 aa  528  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1041 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1039 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1033 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.92 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1038 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1022 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1037 aa  526  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1058 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1036 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1033 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.11 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.06 
 
 		 1040 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1055 aa  522  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 		 1034 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1022 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  34.52 
 
 		 1405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1014 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  32.43 
 
 		 1036 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1059 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1032 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1048 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1037 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1032 aa  516  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1042 aa  515  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1027 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1043 aa  512  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1031 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1040 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 		 1049 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.93 
 
 		 1049 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 		 1024 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1051 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1042 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1029 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1171 aa  505  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1044 aa  506  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.12 
 
 		 1018 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1014 aa  505  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>