More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0742 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
386 aa  766    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  55.73 
 
 
387 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
384 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
382 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
398 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
388 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.66 
 
 
371 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  30.03 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
385 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
391 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.35 
 
 
388 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
379 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
377 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
384 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  28.57 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
375 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
236 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  38.91 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
389 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
353 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
377 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
378 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
369 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
364 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
387 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
370 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
387 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
401 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  30.14 
 
 
372 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
392 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
395 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
370 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
366 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
436 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
394 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
376 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
399 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
392 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
386 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
383 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
370 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
395 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
396 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
373 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
390 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  29.72 
 
 
382 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
376 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  31.65 
 
 
376 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
368 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
401 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
374 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  30.33 
 
 
364 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
368 aa  99.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
364 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
376 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
386 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
387 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  24.5 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  45.03 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.8 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.73 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
394 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>