More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0642 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 347 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  66.47 
 
 		 341 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  55.71 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  57.02 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  54.47 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  39.08 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  37.22 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  37.04 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  35.45 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  36.23 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  35.75 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.85 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.85 
 
 		 398 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  34 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  34.49 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  36.34 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  39.29 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  33.46 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.1 
 
 		 367 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  31.19 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.19 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  25.88 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  29.36 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  29.36 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  32.22 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.4 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  29.94 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.54 
 
 		 490 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  24.22 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  37.01 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  27.73 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  27.43 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  24.83 
 
 		 632 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  24.83 
 
 		 632 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.65 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  30.81 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  29.15 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.06 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.56 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.39 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 		 489 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  34.64 
 
 		 520 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 		 503 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  31.28 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.51 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  29.19 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.38 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25.75 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5407  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  26.45 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  26.8 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.05 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.72 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  29.81 
 
 		 477 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  30 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 		 541 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.43 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  24.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 		 513 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  29.31 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  21.2 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  24.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>