More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0587 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  75.86 
 
 
256 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  56.98 
 
 
250 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  58.08 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  55.6 
 
 
250 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  57.36 
 
 
250 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  57.36 
 
 
250 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  57.75 
 
 
250 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  57.92 
 
 
250 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  56.98 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  56.37 
 
 
250 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  54.44 
 
 
250 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  56.59 
 
 
250 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.38 
 
 
251 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.62 
 
 
251 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.78 
 
 
256 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.39 
 
 
256 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.58 
 
 
256 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  50.39 
 
 
256 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  49.81 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  50.59 
 
 
255 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  51.57 
 
 
254 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50 
 
 
256 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50 
 
 
256 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.39 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  50 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.6 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  50.39 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50 
 
 
256 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  50.8 
 
 
256 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  57.65 
 
 
258 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  49.21 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  48.83 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  49.42 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  49.42 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  49.21 
 
 
254 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  50.59 
 
 
253 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  47.27 
 
 
258 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  49.21 
 
 
256 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  51.59 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  50 
 
 
259 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  47.22 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  47.2 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  49.6 
 
 
259 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  49.22 
 
 
250 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  49.22 
 
 
250 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  48.41 
 
 
261 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  48.46 
 
 
260 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  44.4 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.04 
 
 
207 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  48.04 
 
 
207 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  47.55 
 
 
207 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  45.95 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.55 
 
 
207 aa  188  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 
207 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  47.06 
 
 
204 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  47.06 
 
 
212 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  49.47 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  46.78 
 
 
173 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.04 
 
 
261 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.9 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  32.65 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  27.82 
 
 
261 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.82 
 
 
258 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  27.82 
 
 
261 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.82 
 
 
258 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.82 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.42 
 
 
261 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
264 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.42 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.76 
 
 
257 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.87 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.86 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.57 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.14 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.02 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.82 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.72 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.11 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  27.38 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.61 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.49 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.12 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  26.67 
 
 
658 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>