More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0584 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2815  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  67.38 
 
 
506 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  70.49 
 
 
507 aa  682    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0584  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
499 aa  1000    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0526  cell wall hydrolase/autolysin  83 
 
 
497 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2409  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  68.22 
 
 
507 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3216  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.65 
 
 
526 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.66 
 
 
515 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.4 
 
 
514 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0746  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.65 
 
 
522 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2611  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.57 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2500  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.15 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.15 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, AMIC precursor protein  59.15 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5895  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.67 
 
 
508 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0907  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.15 
 
 
518 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0910  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.15 
 
 
518 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0733  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  61.17 
 
 
505 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2482  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.67 
 
 
515 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0672514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  59.15 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.292024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.23 
 
 
504 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.23 
 
 
508 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.095859  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  58.69 
 
 
454 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.33 
 
 
448 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1262  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.57 
 
 
452 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.826709  normal  0.137617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3199  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.96 
 
 
471 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.384074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.27 
 
 
474 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.125384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1170  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.79 
 
 
519 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0759959  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.39 
 
 
483 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.99 
 
 
482 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.951769  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5127  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.02 
 
 
496 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498717  normal  0.873024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.35 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.418715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3049  cell wall hydrolase/autolysin  51.48 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.0314787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1305  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.15 
 
 
517 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.12 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.33 
 
 
456 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1783  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.21 
 
 
465 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3260  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.2 
 
 
417 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.56 
 
 
419 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2964  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0874  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02626  hypothetical protein  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3137  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3045  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2963  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  44.35 
 
 
417 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 
416 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.14 
 
 
416 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.35 
 
 
416 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.95 
 
 
412 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.28 
 
 
414 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.63 
 
 
414 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.92 
 
 
417 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1952  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  76.72 
 
 
503 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  66.39 
 
 
418 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.47 
 
 
471 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  43.02 
 
 
471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0337  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.41 
 
 
472 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000027639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.73 
 
 
475 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  62.78 
 
 
413 aa  289  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.695553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  57.76 
 
 
447 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.69 
 
 
476 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.9 
 
 
477 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5676  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.72 
 
 
487 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.538418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.46 
 
 
497 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.72 
 
 
475 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4949  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.64 
 
 
476 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0480001  normal  0.137764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.02 
 
 
443 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.33 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2016  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.95 
 
 
406 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.19 
 
 
405 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0677678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0520  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.34 
 
 
473 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449196  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0843  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.75 
 
 
399 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.807823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  39.37 
 
 
476 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.61 
 
 
576 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  54.55 
 
 
476 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.61 
 
 
476 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.76 
 
 
452 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.02 
 
 
462 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000955274  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3435  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.02 
 
 
462 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000801055  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.66 
 
 
463 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0594  cell wall hydrolase/autolysin  51.02 
 
 
463 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000169523  decreased coverage  0.000000280884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
448 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0555  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.2 
 
 
473 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000230448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.2 
 
 
473 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3713  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.2 
 
 
473 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000484801  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.2 
 
 
473 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.97 
 
 
442 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000028113  unclonable  0.00000000000694269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
440 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3463  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  49.42 
 
 
299 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.16 
 
 
455 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.14 
 
 
439 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.32 
 
 
439 aa  236  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5657  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.64 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.98 
 
 
455 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.95 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.83 
 
 
472 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
397 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.86 
 
 
447 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>