97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0561 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  54.19 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  53.99 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  27.44 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.44 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  26.05 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  28.19 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  24.38 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  24.73 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.42 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.54 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  23.96 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.68 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  25.59 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  25.82 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.88 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  26.67 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.36 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.29 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  47.69 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.54 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  24.75 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  19.74 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  25.72 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 188 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  46.55 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.34 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  26.37 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  42.62 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.16 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  43.48 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  27.31 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  23.5 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3235  hypothetical protein  38.98 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3324  LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  23.53 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4049  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 275 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00251355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>