37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0552 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  38.3 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 615 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  32.65 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  48.86 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  31.63 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2283  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3015  hypothetical protein  31.45 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal  0.0180301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  41.75 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  47.13 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  45.05 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  48.35 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  43.96 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  43.96 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  41.76 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2978  hypothetical protein  45.59 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3014  hypothetical protein  48.44 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.0167058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  37.62 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  38.82 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  31.01 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  38.82 
 
 		 94 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  31.39 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  25.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  30.52 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  28.14 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  30.32 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  29.22 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  29.09 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>