199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0497 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  57.36 
 
 		 813 aa  926    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  56.39 
 
 		 811 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 810 aa  1654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  44.37 
 
 		 786 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  44.46 
 
 		 789 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  73.21 
 
 		 824 aa  1247    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  57.36 
 
 		 813 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  44.37 
 
 		 786 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  45.17 
 
 		 788 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  43.99 
 
 		 788 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  43.22 
 
 		 786 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  43.61 
 
 		 786 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  43.86 
 
 		 786 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  43.86 
 
 		 786 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  43.86 
 
 		 786 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  42.03 
 
 		 787 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  41.92 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  42.75 
 
 		 761 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  40.55 
 
 		 808 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  40.51 
 
 		 776 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  39.17 
 
 		 841 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  38.7 
 
 		 816 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  38.71 
 
 		 822 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  39.79 
 
 		 814 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  37.63 
 
 		 799 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  38.04 
 
 		 791 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  39.17 
 
 		 783 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  38.3 
 
 		 820 aa  502  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  36.16 
 
 		 860 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  37.79 
 
 		 856 aa  489  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  38.23 
 
 		 836 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  37.67 
 
 		 774 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  36.46 
 
 		 728 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  35.38 
 
 		 819 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  35.8 
 
 		 849 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  34.43 
 
 		 929 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  32.54 
 
 		 803 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  34.39 
 
 		 863 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  32.72 
 
 		 753 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  31.69 
 
 		 757 aa  351  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  30.59 
 
 		 738 aa  343  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  29.52 
 
 		 839 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.3 
 
 		 839 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 		 935 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  30.71 
 
 		 926 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  30.48 
 
 		 1091 aa  330  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.26 
 
 		 826 aa  330  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 932 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  30.3 
 
 		 905 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  30.28 
 
 		 794 aa  320  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 934 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.6 
 
 		 937 aa  317  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.41 
 
 		 924 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  27.85 
 
 		 922 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 938 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  29.93 
 
 		 792 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.16 
 
 		 792 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  31.05 
 
 		 751 aa  313  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.76 
 
 		 919 aa  313  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  29.9 
 
 		 778 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.25 
 
 		 774 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 774 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  28.44 
 
 		 813 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 		 765 aa  300  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.05 
 
 		 764 aa  300  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.5 
 
 		 765 aa  300  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.61 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  27.5 
 
 		 765 aa  298  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 766 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  26.92 
 
 		 773 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 773 aa  295  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  25.94 
 
 		 765 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  25.67 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 821 aa  290  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  25.67 
 
 		 765 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.38 
 
 		 766 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  25.67 
 
 		 765 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 785 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  27.15 
 
 		 787 aa  283  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 		 781 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  29.42 
 
 		 727 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  25.98 
 
 		 799 aa  280  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  29.42 
 
 		 701 aa  280  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  25.7 
 
 		 801 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 786 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  26.45 
 
 		 790 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 786 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 786 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  27.55 
 
 		 786 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 784 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 784 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 784 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 784 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.36 
 
 		 784 aa  273  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>