More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0410 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 230 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  52.76 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  50.46 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  50.46 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 		 261 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 235 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  51.52 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
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NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 194 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
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NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  22.06 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  40.58 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
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NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
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