More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0238 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  100 
 
 		 375 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  71.93 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  65.77 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  59.78 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  54.92 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  54.29 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  54.29 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  54.29 
 
 		 364 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  54.09 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  53.65 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  52.32 
 
 		 366 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  53.46 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  50.42 
 
 		 375 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  51.56 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 413 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  46.49 
 
 		 383 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  45.14 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  47.81 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.86 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  48.15 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.51 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  48.42 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  48.4 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 352 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  46.82 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  41.04 
 
 		 364 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 414 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  44.12 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  44.82 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  44.48 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  46.73 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  41.57 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  44.03 
 
 		 358 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.71 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  45.14 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  42.5 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  45.56 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  44.83 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  43.15 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  46.9 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.26 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  41.38 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41.54 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  46.61 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  44.64 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  41.57 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.91 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 358 aa  236  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  44.31 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.11 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  43.84 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  45.24 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.94 
 
 		 344 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  42.02 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  43.34 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  38.64 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  43.1 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.85 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  41.03 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  42.72 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  39.26 
 
 		 456 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41.88 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  39.08 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  39.19 
 
 		 387 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  42.5 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  43.68 
 
 		 367 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  44.28 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  39.02 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  39.02 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.65 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>