73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0217 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  80.89 
 
 
266 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  72.13 
 
 
251 aa  374  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  73.28 
 
 
251 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  72.54 
 
 
251 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  71.14 
 
 
264 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  70.33 
 
 
253 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  71.19 
 
 
251 aa  350  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  69.11 
 
 
251 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  70.37 
 
 
251 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  70.37 
 
 
251 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  70.37 
 
 
251 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  65.16 
 
 
254 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  59.67 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  58.02 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  58.02 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  56.38 
 
 
254 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  57.2 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  56.97 
 
 
268 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  55.1 
 
 
252 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  54.29 
 
 
252 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  51.25 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  49.59 
 
 
262 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  46.72 
 
 
258 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  46.72 
 
 
258 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  37.7 
 
 
261 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  37.3 
 
 
261 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  43.88 
 
 
252 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  46.61 
 
 
257 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  39.58 
 
 
267 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  38.93 
 
 
247 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  38.93 
 
 
247 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  40.65 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  38.17 
 
 
255 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  40.83 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  37.3 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  35.65 
 
 
241 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  40.19 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  33.77 
 
 
243 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  31.49 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  38.51 
 
 
167 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  34.47 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  36.42 
 
 
167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  39.86 
 
 
158 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  32.75 
 
 
262 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  35.89 
 
 
235 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  31.79 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  33.12 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  33.09 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  36.76 
 
 
148 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  34.23 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  31.03 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  36.76 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  29.66 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  34.87 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  30.67 
 
 
180 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  35.14 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  34.67 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  33.78 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  31.21 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  38.3 
 
 
79 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  29.48 
 
 
179 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  29.61 
 
 
162 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.91 
 
 
74 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  42.03 
 
 
93 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  30.28 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  31.65 
 
 
84 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  36.62 
 
 
82 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  32.89 
 
 
84 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  31.43 
 
 
77 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>