More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0066 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  74.55 
 
 		 236 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  67.11 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  64.44 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  64.16 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  49.73 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  49.46 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  45.26 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  45.26 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  49.24 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  45.09 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.55 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  44.54 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  44.64 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  47.94 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  50.31 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  50.63 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  49.69 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  49.39 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  49.39 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  49.39 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  47.59 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  49.39 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  40.62 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 490 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.62 
 
 		 684 aa  115  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.63 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.1 
 
 		 838 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.61 
 
 		 961 aa  111  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 557 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.52 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.95 
 
 		 831 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 393 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.36 
 
 		 2413 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.06 
 
 		 789 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.86 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1037 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.68 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1402 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.51 
 
 		 489 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.46 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 1032 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.67 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 1012 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.12 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1493 aa  99  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.99 
 
 		 376 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 976 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.18 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.09 
 
 		 425 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 448 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1141 aa  96.3  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  38.29 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 763 aa  95.9  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.96 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.93 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.22 
 
 		 685 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.12 
 
 		 731 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  31.95 
 
 		 348 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 380 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.1 
 
 		 208 aa  92.8  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.66 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.09 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.23 
 
 		 392 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1002 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1877 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 		 341 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 		 865 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  34.42 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.6 
 
 		 373 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.03 
 
 		 343 aa  89  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  34.91 
 
 		 416 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  40.46 
 
 		 315 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.86 
 
 		 464 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.73 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  32.43 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.37 
 
 		 528 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  41.8 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  38.12 
 
 		 304 aa  86.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 346 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.96 
 
 		 680 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  31.89 
 
 		 410 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.97 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.68 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  39.34 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.17 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  39.22 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.47 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 940 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  39.22 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  29.33 
 
 		 839 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.68 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  39.22 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>