More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0045 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  85.71 
 
 		 471 aa  838    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  77.42 
 
 		 471 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  100 
 
 		 473 aa  971    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  85.71 
 
 		 471 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  89.64 
 
 		 472 aa  880    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  66.38 
 
 		 475 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  66.03 
 
 		 478 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  62.31 
 
 		 479 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  61.01 
 
 		 484 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  60.54 
 
 		 484 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  56.13 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  56.75 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  54.66 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  57.2 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  55.21 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  54.94 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  50 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  47.07 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  47.07 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  46.97 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  49.27 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  45.91 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  44.53 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  45.99 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  45.36 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  44.32 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  42.24 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.7 
 
 		 469 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  41.08 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  45.53 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  40.8 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  42.21 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  40.8 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  42.03 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  40.8 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  40.64 
 
 		 469 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  41.06 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.8 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  39.32 
 
 		 471 aa  320  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  38.45 
 
 		 478 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  38.15 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.7 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  38.44 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  38.44 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  37.61 
 
 		 457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  38.74 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  39.4 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  39.18 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  38.66 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  38.23 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  39.06 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  37.17 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  37.17 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  38.06 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  38.06 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  38.06 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  38.06 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  38.06 
 
 		 461 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  38.06 
 
 		 465 aa  296  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  38.06 
 
 		 465 aa  296  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  37.2 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  38.06 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  37.45 
 
 		 485 aa  293  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  39.51 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  37.5 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  36.52 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  41.67 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  37.39 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  40 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  37.28 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  36.99 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  38.92 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  35.56 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  37.2 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  37.85 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  36.56 
 
 		 479 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  35.21 
 
 		 487 aa  279  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  35.59 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  36.83 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  36.77 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  36.77 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  38.46 
 
 		 467 aa  272  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  36.05 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.19 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  37.15 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  40.69 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  35.82 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  35.82 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  37.04 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  35.78 
 
 		 481 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  35.96 
 
 		 485 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  35.96 
 
 		 485 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  36.77 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  35.74 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  35.96 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  35.68 
 
 		 483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  35.74 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  35.74 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  35.32 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>