More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0042 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  80.48 
 
 
208 aa  324  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  63.69 
 
 
231 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  63.69 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  69.62 
 
 
202 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  65.06 
 
 
208 aa  236  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  61.33 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  65.41 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  65.29 
 
 
193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  64.67 
 
 
213 aa  231  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  66.67 
 
 
205 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  65.61 
 
 
195 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  62.09 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  62.66 
 
 
185 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  52.94 
 
 
191 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  55.56 
 
 
180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  54.94 
 
 
184 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  70.69 
 
 
151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  51.23 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  51.23 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  52.47 
 
 
183 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  51.85 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  51.23 
 
 
183 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  51.85 
 
 
183 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  56.05 
 
 
185 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  50.6 
 
 
179 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  49.11 
 
 
186 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  50.6 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  48.86 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  49.11 
 
 
184 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  50.6 
 
 
179 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  49.4 
 
 
176 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.93 
 
 
183 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  58.82 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  49.46 
 
 
184 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  48.21 
 
 
179 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  47.02 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  59.85 
 
 
195 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  46.99 
 
 
203 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  46.99 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  46.39 
 
 
203 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  50.96 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  46.11 
 
 
177 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.34 
 
 
161 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  48.12 
 
 
199 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  52.78 
 
 
158 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  48.7 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  51.33 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  46.01 
 
 
192 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  53.19 
 
 
158 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  51.03 
 
 
158 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  52.45 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  45.62 
 
 
181 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  49.01 
 
 
170 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  53.52 
 
 
185 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  50.39 
 
 
176 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  52.05 
 
 
165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  50.39 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  43.21 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  51.05 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  52.05 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  51.01 
 
 
168 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  48.65 
 
 
182 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44.3 
 
 
158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.02 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50 
 
 
162 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  49.08 
 
 
164 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  48.68 
 
 
159 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  51.37 
 
 
165 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  48.68 
 
 
162 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  51.01 
 
 
164 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  50.64 
 
 
164 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  52.86 
 
 
171 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  51.37 
 
 
160 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  51.68 
 
 
158 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  41.11 
 
 
190 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  50.64 
 
 
164 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50.68 
 
 
161 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  51.02 
 
 
159 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  51.03 
 
 
158 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  51.02 
 
 
159 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  51.02 
 
 
159 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  50.34 
 
 
159 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  53.33 
 
 
160 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  50.34 
 
 
159 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52.21 
 
 
165 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  52.74 
 
 
164 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  51.47 
 
 
165 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  50.68 
 
 
161 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>