More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0033 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  100 
 
 
446 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  60.72 
 
 
450 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  62.32 
 
 
455 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  54.04 
 
 
441 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  53.19 
 
 
439 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 
440 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  46.28 
 
 
437 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5345  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 
441 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12669  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.04 
 
 
445 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  49.09 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  49.17 
 
 
436 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  46.3 
 
 
443 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.73 
 
 
434 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  45.79 
 
 
437 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  46.71 
 
 
454 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  46.71 
 
 
443 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.5 
 
 
434 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 
440 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  47.11 
 
 
441 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  48.05 
 
 
440 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.73 
 
 
434 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 
449 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
444 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 
444 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.5 
 
 
434 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.5 
 
 
434 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.5 
 
 
434 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.99 
 
 
442 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.79 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.4 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.27 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.79 
 
 
441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.79 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  46.6 
 
 
454 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  47.36 
 
 
442 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  46.56 
 
 
441 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  46.28 
 
 
441 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
469 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  44.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.16 
 
 
442 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.73 
 
 
452 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  44.89 
 
 
440 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  46.15 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  44.84 
 
 
441 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  45.13 
 
 
433 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  44.26 
 
 
441 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  45.39 
 
 
443 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  45.8 
 
 
436 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.96 
 
 
451 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  47.45 
 
 
435 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.06 
 
 
439 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  43.86 
 
 
442 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  46.4 
 
 
456 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  45.8 
 
 
436 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  46.93 
 
 
459 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  45.5 
 
 
445 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 
439 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  46.4 
 
 
456 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  44.18 
 
 
440 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  44.42 
 
 
442 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5038  major facilitator transporter  50.61 
 
 
438 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178058  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  45.9 
 
 
449 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
469 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  48.16 
 
 
437 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  46.71 
 
 
477 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  45.56 
 
 
436 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
441 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.89 
 
 
433 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  44.29 
 
 
442 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  44.42 
 
 
442 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 
441 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  43.58 
 
 
443 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.47 
 
 
439 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  44.92 
 
 
442 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.43 
 
 
462 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  46.9 
 
 
437 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  47.63 
 
 
449 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  47.22 
 
 
440 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  44.26 
 
 
434 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.66 
 
 
433 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  45.68 
 
 
459 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 
443 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  45.07 
 
 
435 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  44.26 
 
 
436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 
445 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  44.19 
 
 
441 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  44.19 
 
 
441 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
445 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  42.53 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  42.53 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  43.69 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  47.92 
 
 
435 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.92 
 
 
435 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.92 
 
 
435 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.92 
 
 
435 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  44.19 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>