134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0028 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  69.41 
 
 
219 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.93 
 
 
219 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.93 
 
 
219 aa  284  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  63.93 
 
 
219 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.64 
 
 
219 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.93 
 
 
219 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.93 
 
 
219 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.93 
 
 
219 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.35 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.19 
 
 
219 aa  257  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.73 
 
 
219 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.76 
 
 
217 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.66 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  38.26 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.26 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.04 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.02 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.11 
 
 
189 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.73 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.15 
 
 
189 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.45 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.3 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  25.57 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  38.38 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  35.11 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.74 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.41 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.67 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.3 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  39.08 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.39 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.71 
 
 
199 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.67 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.45 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.14 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  36.36 
 
 
90 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.2 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  30.3 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.67 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.37 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  30.3 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.39 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.37 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  27.78 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  31.79 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  34 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.52 
 
 
229 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.84 
 
 
207 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  51.6  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.97 
 
 
159 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.43 
 
 
157 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.39 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.2 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  28.26 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.32 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  37.65 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  37.65 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  29.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.71 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.62 
 
 
161 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.49 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.77 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.25 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06162  Prenylcystein carboxymethyl transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI75]  29.32 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.423115  normal  0.603581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.06 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.51 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  28.91 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.16 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  31.58 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32.41 
 
 
147 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  35.34 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.6 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  35 
 
 
253 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
205 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  32.29 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  35.34 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  35.34 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.87 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  30.59 
 
 
1020 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>