273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0021 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  87.63 
 
 		 299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  81.56 
 
 		 282 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  79.79 
 
 		 282 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  78.01 
 
 		 282 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  79.08 
 
 		 282 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  78.72 
 
 		 282 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  78.72 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  79.79 
 
 		 282 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  79.79 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  79.79 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  74.47 
 
 		 282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  74.47 
 
 		 303 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  63.48 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  59.93 
 
 		 280 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  60.42 
 
 		 281 aa  354  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  60.64 
 
 		 281 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  59.36 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  54.58 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  51.07 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  53.07 
 
 		 304 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  52.54 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  51.79 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  49.28 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  46.32 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  43.45 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.84 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  39.25 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.84 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  40.7 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.91 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  40.7 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.29 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.68 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  40.7 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  39.16 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  38.7 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  39.31 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.55 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  39.31 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.97 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  36.42 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.44 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  37.42 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  38.59 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  35.71 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.12 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  36.95 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  36.81 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  37.33 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  35.29 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  37.89 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.99 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  37.88 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  36.48 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  33.77 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  36.16 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  36.82 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  34.92 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.3 
 
 		 315 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  36.39 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  36.99 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  34.94 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  36.99 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  35.64 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  37.18 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  36.27 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  35.5 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  35.5 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  35.42 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>