More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4373 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  75.75 
 
 
274 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  62.79 
 
 
271 aa  296  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  47.45 
 
 
270 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
253 aa  221  1e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
272 aa  216  3e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 
308 aa  208  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  49.23 
 
 
293 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
292 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  47.45 
 
 
266 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  47.62 
 
 
265 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  47.45 
 
 
266 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  47.45 
 
 
266 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  46.85 
 
 
261 aa  197  1e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  47.22 
 
 
253 aa  197  2e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
264 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  46.96 
 
 
265 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  49.17 
 
 
284 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  45.56 
 
 
269 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  43.45 
 
 
269 aa  185  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 
266 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
256 aa  181  8e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  50.42 
 
 
266 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  46 
 
 
272 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  46.22 
 
 
258 aa  179  6e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
268 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  44.23 
 
 
262 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
262 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  42.32 
 
 
260 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  40.41 
 
 
269 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77386e-06 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  44.96 
 
 
261 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  46.28 
 
 
267 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.58 
 
 
255 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.08332e-07  hitchhiker  8.85497e-15 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 
255 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 
262 aa  174  1e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 
264 aa  173  3e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  40.15 
 
 
262 aa  173  3e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  42.21 
 
 
259 aa  173  3e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.173e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
277 aa  173  3e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  49.58 
 
 
272 aa  172  4e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
259 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
259 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.69 
 
 
267 aa  172  6e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 
254 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  46.64 
 
 
267 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.94 
 
 
268 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.43 
 
 
264 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.73 
 
 
409 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  9.791e-05  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
275 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.22 
 
 
405 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  41.87 
 
 
269 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
255 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 
255 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.62531e-09  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  37.94 
 
 
259 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.02185e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.93 
 
 
268 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.84 
 
 
262 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  44.44 
 
 
272 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
259 aa  166  3e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  45.3 
 
 
261 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  45.3 
 
 
261 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.24 
 
 
272 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  45.3 
 
 
261 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.39 
 
 
260 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.45 
 
 
424 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  42.19 
 
 
255 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  1.46988e-14 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 
255 aa  165  6e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.51345e-05  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.8 
 
 
418 aa  165  7e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.98 
 
 
264 aa  165  7e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  35.69 
 
 
259 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  43.5 
 
 
257 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.86 
 
 
255 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  9.29505e-13 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 
265 aa  164  1e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.87 
 
 
257 aa  164  1e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  46.75 
 
 
268 aa  164  1e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  44.74 
 
 
255 aa  164  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  164  2e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 
274 aa  163  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
263 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.63 
 
 
288 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40.16 
 
 
260 aa  162  4e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.43522e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.4 
 
 
271 aa  162  5e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  42.26 
 
 
290 aa  162  5e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.59 
 
 
260 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.46 
 
 
266 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  38.65 
 
 
272 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
272 aa  161  8e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
276 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  39.44 
 
 
424 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
272 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.59 
 
 
253 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
272 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
272 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
272 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  38.49 
 
 
277 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  41.22 
 
 
288 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.75 
 
 
266 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.67 
 
 
414 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>