More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4321 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  96.39 
 
 
194 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  86.93 
 
 
187 aa  324  4e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  76.29 
 
 
188 aa  305  2e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  65.71 
 
 
201 aa  245  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  61.63 
 
 
177 aa  231  4e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  61.63 
 
 
177 aa  231  4e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  61.05 
 
 
177 aa  229  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.69889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  61.63 
 
 
175 aa  224  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.72103e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  54.91 
 
 
175 aa  223  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.2864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  57.8 
 
 
175 aa  220  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.47395e-09  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  61.05 
 
 
175 aa  219  2e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.00106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 
177 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  56.65 
 
 
174 aa  212  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.27534e-14  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  57.23 
 
 
175 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.33733e-06  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  56.82 
 
 
181 aa  208  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  50 
 
 
203 aa  207  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  49.14 
 
 
178 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  50 
 
 
266 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.45 
 
 
176 aa  197  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  55.68 
 
 
178 aa  196  2e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  1.9364e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  54.29 
 
 
172 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  53.71 
 
 
182 aa  195  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  53.71 
 
 
182 aa  195  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  53.71 
 
 
176 aa  194  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.96245e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.31665e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  53.14 
 
 
182 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  52.57 
 
 
177 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  47.7 
 
 
177 aa  189  3e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  52.27 
 
 
178 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  2.31337e-05 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.59 
 
 
267 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 
177 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.96375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  52.63 
 
 
181 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  3.24122e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  48.59 
 
 
203 aa  184  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  49.14 
 
 
180 aa  184  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.57799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.09778e-09  unclonable  4.06083e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.61698e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.32326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.76433e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  47.43 
 
 
194 aa  184  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 
177 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.81772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 
177 aa  183  1e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  47.67 
 
 
183 aa  183  2e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  46.03 
 
 
273 aa  182  2e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  48.62 
 
 
277 aa  182  2e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.29 
 
 
176 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.61776e-05  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  44.1 
 
 
193 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  47.46 
 
 
185 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  44.1 
 
 
193 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  47.46 
 
 
185 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  8.22613e-07 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  46.99 
 
 
306 aa  182  4e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  46.24 
 
 
176 aa  182  4e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.42 
 
 
199 aa  181  5e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  47.75 
 
 
181 aa  181  5e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.64949e-09  unclonable  2.28976e-08 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.44 
 
 
185 aa  181  5e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 
177 aa  181  5e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  48.9 
 
 
183 aa  181  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
270 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  45.16 
 
 
196 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
270 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  48.07 
 
 
273 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  47.19 
 
 
266 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 
174 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.07525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  42.92 
 
 
266 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  46.89 
 
 
185 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  47.43 
 
 
243 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  43.06 
 
 
238 aa  181  8e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  45.1 
 
 
276 aa  181  9e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  45.16 
 
 
196 aa  180  9e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  45.1 
 
 
242 aa  180  9e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  48.28 
 
 
188 aa  181  9e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  46.78 
 
 
173 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  45.59 
 
 
242 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  45.93 
 
 
175 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  43.54 
 
 
272 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
271 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  45.93 
 
 
175 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  45.3 
 
 
183 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.71251e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  47.13 
 
 
181 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.36415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.649e-05  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  44.02 
 
 
197 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  45.66 
 
 
177 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  45.21 
 
 
250 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  48 
 
 
202 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 
181 aa  178  3e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 
181 aa  178  3e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 
181 aa  178  3e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.75303e-08  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  45.98 
 
 
175 aa  179  3e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 
181 aa  179  3e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.25159e-09  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 
177 aa  179  3e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>