More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4301 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.75 
 
 		 577 aa  920    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 579 aa  1188    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 557 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  43.7 
 
 		 554 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  47.87 
 
 		 910 aa  283  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  44.1 
 
 		 998 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 977 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.8 
 
 		 917 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.81 
 
 		 970 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 791 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.86 
 
 		 1003 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 395 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 575 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.62 
 
 		 1022 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 		 796 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 		 858 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 		 927 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 569 aa  220  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 633 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 699 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 785 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 574 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 798 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 		 975 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 937 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 631 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 		 974 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 803 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  44.84 
 
 		 792 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 989 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 616 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.61 
 
 		 1346 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 		 989 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  40.21 
 
 		 565 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 646 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 763 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 573 aa  194  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  40.96 
 
 		 576 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 		 1124 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 1267 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 932 aa  193  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 817 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 1046 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 1433 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.07 
 
 		 751 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.69 
 
 		 2213 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 984 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  35.79 
 
 		 1001 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  42.97 
 
 		 631 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 		 991 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 882 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 657 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.49 
 
 		 592 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  44.23 
 
 		 977 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1068 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.16 
 
 		 1361 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 		 1165 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1240 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 765 aa  187  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 1350 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 721 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1131 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1070 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  39.6 
 
 		 736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 1029 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.77 
 
 		 1442 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  43.13 
 
 		 900 aa  185  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 1135 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 957 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 679 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1362 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 1285 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1126 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  41.25 
 
 		 882 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  41.13 
 
 		 803 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 737 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 823 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 995 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 720 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 		 767 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 818 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 581 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  40.43 
 
 		 1196 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  40.08 
 
 		 693 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1118 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.98 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.76 
 
 		 1653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 1287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 700 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 1193 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  41.54 
 
 		 1077 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>