More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4283 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  79.87 
 
 		 160 aa  251  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  67.63 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  49.41 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  56.2 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  45.99 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  48.55 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  48.15 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  42.25 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  40.14 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  42 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  44.19 
 
 		 446 aa  107  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.78 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.65 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  47.46 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  47.46 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  40.27 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  45.59 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  38.67 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  44.78 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  41.3 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.58 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  40.99 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  40.6 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.13 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  44.72 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.86 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  46.48 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  40.99 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  36.6 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  45.8 
 
 		 301 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  36.6 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  41.25 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  44.72 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  35.33 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  42.03 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  43.38 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  36.36 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  46.15 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45.31 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  40.3 
 
 		 190 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  43.48 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  40.15 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  36.91 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  44.17 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  37.4 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  48.42 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.73 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  35.14 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  40.15 
 
 		 195 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  34.78 
 
 		 137 aa  85.1  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  42.73 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  37.61 
 
 		 143 aa  84  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  35.11 
 
 		 155 aa  84  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  42.73 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  42.28 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  46.9 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  41.12 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  45.24 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  38.94 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  40.34 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  36.5 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.36 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  38.98 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  41.13 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  37.61 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  39.82 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  40.5 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  41.88 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  39.64 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  44.09 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  43.1 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  40.71 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  41.59 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  37.93 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  43.22 
 
 		 411 aa  77.4  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  40.34 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  44.54 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  43.36 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  34.71 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.15 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  40.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>