More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4271 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  797    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  85.1 
 
 
408 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  55.36 
 
 
384 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  45.5 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  39.5 
 
 
382 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
386 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
370 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 
370 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
385 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
397 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
374 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
417 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
366 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
370 aa  213  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
366 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
371 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
371 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
387 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
387 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
373 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
431 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
393 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
374 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 
383 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
360 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
380 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 
346 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  42.14 
 
 
346 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
367 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.26 
 
 
375 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
378 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  35.54 
 
 
380 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.07 
 
 
381 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
378 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  29.12 
 
 
375 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
434 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
435 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
535 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
381 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
382 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.1 
 
 
430 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
376 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  29.95 
 
 
381 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
371 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
524 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
355 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  29.19 
 
 
381 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
361 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.73 
 
 
351 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 
380 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
376 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
364 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
364 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
395 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
372 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  33.66 
 
 
364 aa  166  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.29 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  44.17 
 
 
394 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.29 
 
 
372 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.03 
 
 
379 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
372 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 
340 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.73 
 
 
375 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
361 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
367 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
376 aa  159  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.73 
 
 
375 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.25 
 
 
374 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
366 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  36.27 
 
 
353 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
376 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
371 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
360 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  43.15 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  37.45 
 
 
1261 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
372 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
394 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
394 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.1 
 
 
374 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
609 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
343 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
378 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
382 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
1915 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>