More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4216 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  100 
 
 		 486 aa  977    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  84.88 
 
 		 455 aa  757    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  46.04 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  39.82 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  40.23 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  39.37 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  38 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.46 
 
 		 481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.78 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.73 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.73 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.73 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  39.02 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.16 
 
 		 461 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.06 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.46 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  36.04 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.3 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.56 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.18 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  39.34 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.41 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.41 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.75 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.94 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.75 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.64 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 473 aa  220  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  35.07 
 
 		 485 aa  220  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.6 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.7 
 
 		 467 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.35 
 
 		 484 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.35 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.28 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  40.52 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.6 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  33.86 
 
 		 471 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.74 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.4 
 
 		 464 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  35.54 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  38.24 
 
 		 407 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.72 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.05 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.73 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.3 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  32.3 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.53 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  40.96 
 
 		 384 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  32.54 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.05 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  31.93 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  36.17 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  33.03 
 
 		 471 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  34.48 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.75 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.78 
 
 		 414 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  32.51 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.22 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.47 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  33.15 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  33.15 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.26 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  32.87 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  31.03 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.71 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  35.25 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.63 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  35.11 
 
 		 453 aa  183  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  35.11 
 
 		 453 aa  183  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  35.59 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  37.08 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  34.4 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  40.57 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.34 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  47.41 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  34.4 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  40.67 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  42.55 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.42 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  43.02 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  40.61 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  39.24 
 
 		 395 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  34.67 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  35.63 
 
 		 467 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.95 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  35.48 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  40.15 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  37.07 
 
 		 391 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  42.03 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.63 
 
 		 435 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.83 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.74 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  31.68 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  33.53 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>