More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4211 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  97.13 
 
 		 522 aa  1042    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  73.2 
 
 		 518 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  79.69 
 
 		 520 aa  847    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1067    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 878 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 		 810 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 1737 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 673 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 909 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.94 
 
 		 1979 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 		 1694 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 		 1022 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 4079 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1676 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.03 
 
 		 733 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.7 
 
 		 639 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.26 
 
 		 795 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 847 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1421 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 573 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 988 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 		 1486 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.88 
 
 		 887 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1276 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26 
 
 		 936 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.25 
 
 		 818 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.69 
 
 		 573 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.11 
 
 		 573 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 566 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.93 
 
 		 816 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 649 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 762 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 3172 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 567 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.95 
 
 		 1056 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 562 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 362 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.14 
 
 		 725 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.56 
 
 		 3301 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 1056 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 927 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 2240 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 3145 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 634 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.01 
 
 		 784 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 808 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.77 
 
 		 638 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 689 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.12 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 4489 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.62 
 
 		 676 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.84 
 
 		 730 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 597 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 435 aa  88.2  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.99 
 
 		 340 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 1069 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.45 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.33 
 
 		 1013 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 		 955 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 643 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  27.41 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.32 
 
 		 1154 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.59 
 
 		 725 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.43 
 
 		 837 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.84 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 1297 aa  81.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.3 
 
 		 875 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.01 
 
 		 620 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 		 643 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1112 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.25 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 2262 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1094 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.37 
 
 		 707 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.72 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 573 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 594 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>