More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4206 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 741 aa  1459    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  52.02 
 
 		 740 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  86.41 
 
 		 742 aa  1281    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 762 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 679 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 679 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 772 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 		 764 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  36 
 
 		 734 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 784 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 756 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 777 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  33.07 
 
 		 764 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  32.26 
 
 		 798 aa  360  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 777 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  33.72 
 
 		 768 aa  354  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.63 
 
 		 763 aa  353  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.68 
 
 		 769 aa  353  8e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 783 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.93 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.14 
 
 		 769 aa  351  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  31.82 
 
 		 774 aa  350  5e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 865 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 760 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 865 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.73 
 
 		 769 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 755 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  33.42 
 
 		 764 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 705 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.73 
 
 		 770 aa  337  5.999999999999999e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.9 
 
 		 764 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 705 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.14 
 
 		 789 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 934 aa  334  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.63 
 
 		 770 aa  333  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 649 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 781 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 878 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.59 
 
 		 752 aa  330  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 801 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.22 
 
 		 785 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 695 aa  328  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 766 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 2539 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 804 aa  324  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 808 aa  324  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 767 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 762 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 756 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.74 
 
 		 1866 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31.77 
 
 		 1834 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.84 
 
 		 2336 aa  320  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.23 
 
 		 864 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.23 
 
 		 864 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 864 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  36.16 
 
 		 1079 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 769 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.19 
 
 		 832 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  32.39 
 
 		 769 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.34 
 
 		 1960 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 750 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 911 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 896 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.29 
 
 		 839 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.29 
 
 		 1992 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 896 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  32.19 
 
 		 1987 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 753 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 728 aa  310  5e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 		 769 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 		 769 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  32.06 
 
 		 1989 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 769 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 756 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 770 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 777 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  30.84 
 
 		 803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 706 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 952 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1832 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 598 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 2212 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.72 
 
 		 1956 aa  303  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.46 
 
 		 1971 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.92 
 
 		 974 aa  301  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.31 
 
 		 2301 aa  299  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1974 aa  297  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  31.66 
 
 		 601 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 1065 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  31.51 
 
 		 1643 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 977 aa  294  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1646 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>